Если в безопасном режиме не грузится, то может востановление последней удачной конфигурации может помочь. Винды - штука тёмная, не понятно где кончаются глюки и начинаются фичи...
Для простого и гарантированного уничтожения вирусов, надо удалить старые винды целиком и СРАЗУ после установки новых поставить антивирус(принесенный с другого компа без вирусов) со свежими базами.